O CIEM é uma escola de formação de vocacionados da União Feminina Missionária Batista do Brasil (UFMBB).

A administração é composta de um Conselho Administrativo, cuja sigla é CA é eleito pelo Conselho Geral da UFMBB, constituído por seis membros, e uma Diretora Executiva.

A direção do CIEM, por sua vez é assessorada por um colegiado composto pelo coordenador Administrativo Financeiro, coordenadores acadêmicos e o coordenador da residência.